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そららそさん、はじめまして。

耳の中の黒い点についてですが、私の経験（以前、我が家の子を獣医さんに診てもらい治療）ですが
原因としては、以下のことがあると教えていただきました。
１、汚れ
２、耳ダニや細菌性の炎症（カキカキします）
３、色素の沈着（シミ、ほくろみたいなもの）
４、その他（腫瘍）
我が家の子は、２番でした。
猫ちゃんの耳の病気の場合、カキカキすることが多いそうです。
また、お掃除ですが、綿棒などでこすりすぎると肌に負担がかかるので、やさしくしてあげるようにしてます。

私の経験談になってしまいましたが、獣医さんに診てもらうのが一番だと思います。
今回のようにそららそさんが、猫の異常にはやく気付いて、そして獣医さんに症状を説明すれば、適切な診察、治療、アドバイスがいただけると思います。