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こんにちは。
そのまま様子見で抜けることもありますが、抜けない場合もあります。

我が家の場合は前歯と犬歯辺りの殆どが抜けず、2枚歯になってサメのようになっておりました。
ですので避妊手術をする時に一緒に乳歯も抜いて貰いました。合計8本の歯を抜いています。(先生の判断で重なっていたりしている永久歯も抜いてくださいました)
チワワの口は小さく、歯磨きも歯ブラシが届かなかったりすることが多く、そこに乳歯が混ざってしまうと歯石が永久歯だけの場合よりも溜まりやすくなるため歯周病を起こしやすくなるそうです。

不安もあるかと思いますので、かかりつけの病院で相談をなさってみると良いと思います。
全身麻酔が必要ですので、手術のタイミング等があるようでしたら一緒にされることをおすすめします。